微生物学研究越来越精细化,无论是在精准医学还是更广阔的大健康领域,从原位的角度识别单个细胞是谁和做什么都极具挑战性和意义。
日前,中华预防医学会首届全国生物信息学学术会议在北京成功召开,青岛兴赛生物科技有限公司应邀出席R&D主任朱鹏飞作了题为单细胞代谢功能鉴定和分选的仪器及应用的报告他基于多个临床药敏快速检测应用案例,分享了星赛生物对药敏表型等微生物群原位功能检测,分析,排序和测序的战略创新,展示了拉曼组学在医学研究中的重要应用
大健康领域单细胞精度的研究正在升温,功能表型的原位分析和挖掘成为行业难题。
微生物学在自然界和人类健康中发挥着重要作用,也是精准医学,健康和气候变化的重要资源目前,微生物组研究的思路正在从监测菌群的结构向监测菌群的功能/状态转变,从菌落精度向个体精度转变
根据朱鹏飞的报告,对于微生物组研究来说,从原位的角度识别复杂微生物组样本中每个单个细胞的功能具有重要意义,例如识别其类型,它在使用什么,它在消耗什么,等等目前,相似信息的原位功能分析和挖掘是整个行业的一大挑战
快速,全面,深入的分析,快速检测单细胞拉曼药物敏感性,在临床试验中取得优异的效果。
以临床常见的幽门螺杆菌为例,其国内携带率超过50%—60%,临床合理用药和精确溯源面临挑战其中一大原因是,目前临床医生主要依靠经验用药,而不是在药敏结果的指导下进行准确治疗因此,建立一个高效的药敏诊断,治疗和溯源系统,对于临床及相关疾病的防控非常重要
对此,星赛生物与中科院青岛生物能源与过程研究所,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所等单位的科研人员组成了联合团队,依托其独创的临床单细胞拉曼药敏快速检测系统,可实现病原体快速鉴定,以单细胞精度完成耐药性分析,支持与下游表型和基因型的耦合分析这项研究发表在《临床化学》上
结果表明,单细胞拉曼药敏试验对胃粘膜中Hp的识别准确率可达98%以上基于重水拉曼技术的快速药敏检测,可使Hp对左氧氟沙星和克拉霉素药敏结果的准确性和特异性达到95%以上,药敏检测时间由传统培养法的7—14天缩短至3天
目前,星赛生物的相关仪器和解决方案已经在其他多个临床场景中得到应用,并获得了良好的应用反馈在血液感染领域,常见病原体的药敏试验持续时间可缩短至3小时,实现10倍加速这项研究发表在《生命微生物学》杂志上在口腔领域,发表在《细胞与感染微生物学前沿》上的一项研究表明,单细胞拉曼药敏快速检测技术可以快速评估根管冲洗液的抗菌和杀菌效果,这也说明了该技术在抗菌药物筛选中的应用价值
卫星生物拉曼组技术也有助于发展持久性细菌的诊断技术。
构建细胞功能身份证,拉曼群体技术助力大健康等领域研究。
朱鹏飞表示,Starrace Bio依托拉曼组技术,提供单细胞拉曼成像—分选—测序/培养的解决方案,解决单细胞代谢功能无标记识别,高通量分选等关键瓶颈问题除上述药敏快速检测技术外,公司还拥有基于光镊的单细胞分选仪,基于电介质的高通量流动拉曼分选仪等系列产品和配套解决方案,并获得多项行业权威奖项
拉曼基团的概念是由中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心主任徐健研究员等提出的它是一个具有广谱性,非侵入性,高时空分辨率和单细胞准确性的代谢表型群
根据消息显示,借助于无荧光标记的单细胞拉曼光谱无损全景测量,可以同时表征多种代谢表型的特征,从而测量菌群中单个细胞的原位功能,区分物种,了解内部化合物是如何转化的它还可以测量细胞的环境应激和药物敏感性,以及细胞之间的底物相互作用和代谢相互作用通过这种方法,可以构建菌群的功能身份证,可以在单个细胞的精度上回答谁在做什么,使包括环境菌群,工业菌群,酶资源挖掘等更广泛的研究和工业应用成为可能
拉曼组是单细胞多组学的扩展和延伸。
目前单细胞检测和研究的技术主要由发达国家的大型跨国公司掌握国内基础薄弱,起步较晚此外,缺乏具有国际竞争力的龙头企业,无法形成合理集聚的优势产业在最近在徐健举行的一次学术会议上,他表示希望更多创新型企业和机构参与构建不同原理,不同性能和不同特点的单细胞多组学仪器产业生态系统
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